院校优势
英文基础课程（EIP）
此基础课程是一个至少20周的强化课程，课程不仅包括英文的学习，同时也要学习运用英文解析其他基础学科（数学、科学、IT 和演艺），使需要提高英文水平的学生在进入初中或大学预科主流课程之前做好充分的准备，以具备基本的英文交流、写作和口语技巧。在基础课程中，学生得以在进入正式课程之前先适应新学校的环境和文化，并作为学校大集体的一名正式成员参与学校的一切活动，包括集体聆训、表演艺术课和体育课，藉此在真实的生活环境和实践中提高英文的实际应用能力。通过英文基础课程的学生可选择参加雅思或托福考试。学生将由剑桥英语证书（雅思或托福）颁发委员会评估。成功的考生将获得由剑桥大学 ESOL或TOSEL考试委员会颁发的证书。圣法兰西斯卫理公会教会学校是经批准进行雅思和托福考试的中心，从而为所有的学生提供了极大的方便。
新加坡剑桥中 1 & 2 课程
圣法兰西斯中学中一中二年级为两年制的中学低年级基础课程，在学生进入高年级的专业定向学习之前，为学生提供广泛的学科选择。此阶段课程提供了众多的教学科目，包括各种学术科目以及表演艺术和体育，能为立志升入新加坡剑桥 GCE“O”水准高年级，伦敦IGCSE课程或西澳第9和第10年级的学生们奠定稳固的基础。
在中二考试结束后，学生可以选择继续修读新加坡剑桥GCE“O”水准中三与中四的高年级课程，伦敦IGCSE中学高年级课程或西澳第9第10年级大学预科课程，以便顺利升入理工学院，初级学院或大学预科进而进入理想的大学。中一与中二两年的中学低年级所有考试科目的设立都建立在新加坡教育部列出的剑桥 GCE“O”水准四年教学大纲基础上，符合学校“建立稳固基础”的座右铭。课程同时还包括有趣的实地考察等部分，让学生掌握课程以外的知识，以便学生能体验到相关的研究成果。
新加坡剑桥“O”水准中3&4课程
新加坡教育系统中的中三与中四课程，即新加坡剑桥普通教育证书 GCE“O”水准课程（两年制）。该课程是升入政府理工学院、初级学院、国内外大学的基础课程，受到全世界的普遍承认。这一课程的学习将使学生在更高一级的学习中具备独特的优势，因为此阶段的课程将给学生打下牢固的学术基础，为进一步升学做好准备。
此课程的重点是通过选择适合自己的课程获得最好的成绩，不断加强学生职业发展方面的信息和技能培养，使学生具备更全面的综合能力，为他们将来的学习打下坚实的基础。本校课程提供了广泛的学科选择，学生可根据个人的学术兴趣进行课程选择。每个课程的教学安排合理，而且是两年循序渐进的教学计划，教师能够根据学生不同的语言基础和学习基础挖掘学生个人的学习潜力，并有效地完成教学大纲要求。教师队伍多元化，使得学生能够在多种国际文化的交融中受益。学校具有设备良好的实验室，使学生有足够的实验机会以提高他们的实验技能。相信通过学校的努力加上课程的优势，学校能提供高质量的教学，使学生能够取得优良的成绩，这也是学生今后在全球的市场竞争中所必备的条件。圣法兰西斯卫理公会中学的另一个独特之处在于学校的表演艺术课程。通过学习该课程，学生可以发现和发展自我，并不断学习新的演艺技能，有助于培养学生的情操和积极进取的精神。
伦敦IGCSE中3&4课程
伦敦考试系统（IGCSE）:国际中级普通教育资格证书是一套独特的资格证书。它包括了“O”水准和中级普通教育资格证书（IGCSE）中最佳实践水准。此证书由 Edexcel 颁发；这是伦敦三家颁发学术和业余证书机构中的第一个机构。此证书以完善的教育和学习方法来达到学术上的高标准。此课程还为学生提供了学习上的国际视角。学业成功的学生将会授予国际承认的资格证书，名为国际中级普通教育资格证书（IGCSE）, 与“O”水准和英国中级普通教育证书考试在标准上是相同的。IGCSE具有独特的国际因素，但其中课程内容却允许教师以工作的区域为基础，量体裁衣，使得课程内容与当地的学生更有联系。因此，课程纲要适合于所有国家和不同能力的学生。圣法兰西斯卫理公会教会学校提供此课程的商业专科，科目包括商业学科，会计学以及经济学等等，能充分为学生们在商业专科的进一步深造做好准备。学生在修读这一课程之后，可以顺利地在学校进一步修读国际伦敦“A”水准课程，西澳WACE大学预科课程，以及Edexcel BTEC HND高级大专商业文凭课程。
西澳初中第9&10年级课程
澳大利亚第9-10年级课程是通向WACE第11和12年级的中级课程。课程选择面广泛，包括英语，数学，科学，社会与环境，应用信息通信技术，卫生保健和体育课程及艺术等。学以致用，寓教于乐是老师所重点强调的职责。学校侧重培养学生的创意性，通过小组作业，专题课业，计算机辅助学习等多种教学模式。
国际伦敦“A”水准大学预科课程
国际伦敦普通教育证书 GCE“A”水准课程历史悠久，是高中教育的最高水平，受到全世界的普遍认可。此课程单元制的独特教学模式给了学生独特的优势，为他们打下牢固的学术基础，充分地为学生们进入世界各所大学深造作准备。这个两年制的课程使“A”水准的学生具备综合的技能以加 强今后的学习，为学生在未来事业中处于中层领导的地位。课程确保学生能于选修科目中获取知识，让学生掌握与未来事业发展相吻合的讯息，帮助学生发展批判性思维，培养分析世界时事时 具有独特的见解能力。同时强化英文的口语和写作能力，为学生进入高级学院或大学教育打下牢固的基础。
西澳 WACE 大学预科第11&12年级课程
两年全日制的 WACE 澳洲大学先修班课程第11和12年级是国际认可的大学预科课程，由课程委员会代表西澳大利亚政府负责运作。WACE 相当于剑桥“A”水准，但与欧式教育不同之处在于西澳课程注重应用知识多于讨论抽象的理论。该课程科目选择广泛，可以适当地配合每个学生的学术表现，学生的总成绩以一种平衡的评估方式进行，评估主要由两部分组成：校内评估成绩占 50%，如：专题作业、作业呈现与讲解、校内考试等；西澳大利亚课程委员会主持的校外考试同时也占总成绩的 50%。凭借该成绩，学生可以投档报读新加坡政府各公立大学、中国港澳台及英美加澳的世界大学。Edexcel BTEC HND 高级大专商业文凭课程
BTEC-HND (高级大专商业文凭课程)是一个实用性强的专业化课程。由英国顶尖资格证书颁发机构 Edexcel (现附属 Pearson)进行认证和颁发。为学生在初级商业管理领域打下扎实的基础。该课程目的为学生提供多方面的商业管理知识，适合于想要进入大学深造或计划进修高级专业课程的同学。此外，也适合那些有意向在商业领域及公共管理方面就业的学生们。在学习此课程的过程中，学生有机会发现商业社会的运作，理解商务程序。学生在学习课程的同时也能了解 商业术语并掌握商业技能。英国Edexcel机构已和英国多家大学达成协议，学生在成功完成 BTEC 高级大专商科文凭后，直接进入大学第二年甚至最后一年的大学商科/管理课程。
圣法兰西斯学校也保证学生在完成两年的课程并成功修完课程所需的单元并获取 BTEC 高级大专文凭后便能进入英国伍尔弗汉普顿大学修读商业管理荣誉学士文凭课程，或英国普兹茅斯大学修读商业行政荣誉学士文凭课程，或澳洲南昆士兰大学修读商业学士文凭课程。如欲直接进入上述相关大学最后一年的课程，则以有关大学的入学要求为准。
